学院目前设有药学院、中药学院、中医保健学院、制药工程学院、生物技术学院、医疗器械学院、食品学院、化妆品与艺术设计学院、管理学院、软件学院、国际交流学院、基础部、思想政治理论课教学部及成人教育学院等14个教学单位。